北川縣與震中汶川僅一山之隔，直線距離不過五十多公里。北川縣城幾乎已成平地，據不完全統計，全縣遇難人數已超7000人。飲用水與食品目前成為當地最稀缺的物品，當地居民表示，自5月12日地震發生之後，當地井水變色，呈混濁狀，有腥味。在震後前兩天，當地政府系統幾近癱瘓，災民只能自救，其中飲水主要依賴于雨水、河水。由於近兩天由於氣溫上升，部分死難者的遺體開始腐爛發臭，空氣被嚴重污染。

    為防止疫情爆發，綿竹市第一階段大規模的搜救工作已基本結束，將儘快搜救最後的被埋人員，隨後轉入以醫療救助為主要任務的第二階段；而綿竹市委指揮部的最新通知，從16日開始，挖出的遺體不再認領，即刻深埋。

    在震央汶川縣東南部的綿竹，一些小孩臉上陸續出現紅疹，根據曾經有災區救援經驗的醫師分析，可能是空氣不良所造成的過敏性皮膚炎，但後續不論是飲水還是飲食衛生都很重要，一不注意就可能爆發傳染病。

    天氣預報顯示，阿壩州近幾日的氣溫多在20度左右，天氣忽晴忽雨，而都江堰、德陽、綿竹等地白天最高氣溫最高可達30度，在這樣炎熱潮濕的情況下，屍體腐爛速度加劇，疫情爆發的可能性大大增加。